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组学分析平台介绍:

vwin德赢娱乐组学分析平台是一个基于科研需求的平台,不仅提供常规的质谱服务项目,并且根据学校各课题组的个性化需要开发一些新方法/新技术,以此为各课题组提供全面的蛋白组学、代谢组学以及脂质组学分析的科研支持。

本平台配有先进的质谱仪、半制备高效液相色谱以及常规蛋白组学、代谢组学和脂质组学分析所需要的全套软硬件。已安装并正常运行的质谱仪包括ThermoFisher公司Q ExactiveHF-XQ ExactiveHFOrbitrap Fusion以及Sciex公司的TripleTOF6600Qtrap6500+

平台主任郝丕良博士具有14年以上的蛋白组学科研经验,共发表45篇高质量SCI文章(以第一或通讯作者发表21篇),在蛋白组学样品制备、多维色谱分离、数据处理以及蛋白质翻译后修饰等研究中取得了创新性研究成果。

除了满足校内用户外,本平台还向校外用户开放。服务项目包括常规蛋白组学、代谢组学以及脂质组学分析。如需要大量技术支持和个性化服务的用户,可申请合作项目。


平台主要设备介绍:


1.高分辨质谱仪1 


品牌型号:ThermoFisher Q Exactive HF-X

设备地点:vwin德赢娱乐LB117

联系人:郝丕良

联系电话:20685416

Emailhaopl@shanghaitech.edu.cn  

仪器介绍:Q Exactive™ HF-X 型质谱仪的应用范围日益扩大,为灵敏度、性能和分析效率树立了新标准。Q Exactive HF-X 质谱仪通过高容量传输管实现最大离子负载量,使用电动离子漏斗容纳并传输更宽质量数范围内的离子。

技术指标:扫描速度达 40Hz;分辨率可达240,000FWHM

应用范围:蛋白质组学分析,支持多种定量方法,包括选择离子监测(SIM)、平行反应监测(PRM)和数据独立性采集(DIA)。





2.高分辨质谱仪2 


品牌型号:ThermoFisher Orbitrap Fusion

设备地点:vwin德赢娱乐LB112

联系人:郝丕良

联系电话:20685416

Emailhaopl@shanghaitech.edu.cn  

仪器介绍:赛默飞Orbitrap Fusion Tribrid质谱仪能够进行创新性的深度分析。Orbitrap Fusion质谱仪集四极杆、Orbitrap和离子阱质谱仪的优点于一体,具备了创新性的三合一结构,能够对复杂生物样品进行深度分析。在分析丰度极低、复杂性极高,或者极难分析的样品时能以更快的速度识别更多的化合物,定量更准确,且结构分析更透彻。 

技术指标:质量范围50-6000m/z;分辨率可达500,000FWHM;具备ETDCID以及HCD等断裂模式。

应用范围:蛋白质组学分析。超高质量分辨率是单克隆抗体和其他完整蛋白质分析的理想选择;简单可靠的Thermo Scientific EASY-ETD™离子源可以补充CIDHCD数据,并提高对复杂P™的表征能力。


3.高分辨质谱仪3


品牌型号:ThermoFisher Q Exactive HF

设备地点:vwin德赢娱乐LB112

联系人:郝丕良

联系电话:20685416

Emailhaopl@shanghaitech.edu.cn

仪器介绍:Thermo高分辨质谱定性定量系统主要应用于蛋白质组研究中的蛋白质高分辨、高精度鉴定和定量研究,适于对复杂蛋白质及肽段混合物进行高效分离并进行高灵敏度、高准确性和高通量的分析,另外还可实现多级串联质谱功能,以利于进行基于质谱的结构分析和蛋白质相对定量。

技术指标:扫描速度达 18 Hz;分辨率可达240,000FWHM

应用范围:蛋白质组学分析。Q Exactive HF 质谱仪支持多种定量方法,包括选择离子监测(SIM)、平行反应监测(PRM)和数据独立性采集(DIA)。


4.质谱仪


品牌型号:AB Sciex TripleTOF 6600

设备地点:vwin德赢娱乐LB112

联系人:郝丕良

联系电话:20685416

Emailhaopl@shanghaitech.edu.cn

仪器介绍:AB SCIEX TripleTOF® 6600系统同时具有超快的采集速度、极高的灵敏度和最宽的动态范围,在更短的时间内获得更有意义的研究成果。该系统配备有进行精确定量的分析系统,除能进行常规分析外,还能够在硬件上支持非数据依赖模式的数据高效采集,在软件上能够进行方便、有效的数据处理和分析。

技术指标:30,000高分辨率TOF MS/MS模式;每秒最高100MS/MS扫描。

应用范围:代谢组学和脂质组学分析。


5.质谱仪  



品牌型号:AB Sciex QTRAP 6500+

设备地点:vwin德赢娱乐LB112

联系人:郝丕良

联系电话:20685416

Emailhaopl@shanghaitech.edu.cn

仪器介绍:QTRAP® 6500 LC/MS/MS系统在同一台质谱上能提供最高灵敏度的定量分析数据和定性分析数据。它将串联四极杆的扫描方式和线性离子阱的扫描方式完美地结合在一起。它可以提供最理想的定量限 (LOQ),因而能对要求最严苛的基质中范围最广泛的化合物进行检测和定量分析。

技术指标:由于极性切换性能和 MRM3 速度都得到了提升,QTRAP 6500plus LC-MS/MS 系统可以使用更加快速的色谱法并提高通量。内置的 QTRAP 功能使这个系统只需一次进样就可同时运行定量 MRM 和定性 QTRAP 扫描,从而最大限度地提高通量。

应用范围:代谢组学和脂质组学分析。



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